Alex, Marty, Gloria y Melman todavía están tratando de volver a la Gran Manzana y a su querido zoológico de Central Park, pero primero tienen que encontrar a los pingüinos. Ellos viajan a Monte Carlo, donde atraen la atención de Control de Animales tras un incidente donde se reunieron con los pingüinos, el rey Julien y compañía, los monos, y un integrante recién llegado, una llama.